尼康生物顯微鏡具有卓越光學(xué)性能，合理人機(jī)學(xué)設(shè)計(jì)的正置顯微鏡。E100采用了尼康獨(dú)有的CFI無限遠(yuǎn)光學(xué)系統(tǒng)，并對(duì)色差和場曲進(jìn)行校正，工作距離更長，數(shù)值孔徑更高。新的BE平場消色差系列物鏡專為E100設(shè)計(jì)，確保在各個(gè)放大倍數(shù)下得到清晰明亮的圖像。

    尼康生物顯微鏡配置了卓越的尼康CFI60光學(xué)系統(tǒng)而設(shè)計(jì)的Eclipse 80I提供極佳的高信噪比影像，得到的熒光影像能顯示出淋漓盡致的信息。尼康生物顯微鏡擁有現(xiàn)代化一系列高級(jí)功能的設(shè)計(jì)，采用尼康獨(dú)有的“復(fù)眼照明”技術(shù)，VC平場復(fù)消色差物鏡及應(yīng)用于高端數(shù)字成像顯微鏡系統(tǒng)的智能電動(dòng)數(shù)字成像頭。尼康生物顯微鏡定位的載物臺(tái)手柄，新機(jī)制的載物臺(tái)手柄在載物臺(tái)X/Y大范圍移動(dòng)時(shí)都保持在一個(gè)固定的靠近調(diào)焦旋鈕的位置。操作者的手可以舒服地停留在桌面的同一位置。同時(shí)載物臺(tái)的高度和松緊度都是可調(diào)的。尼康生物顯微鏡采用了新的人機(jī)工程學(xué)目鏡筒可在 10° - 30°自由傾斜，且鏡筒的伸縮幅度可達(dá)40mm。不論使用者的體形如何或顯微鏡安裝了中間模塊，都可以保證操作者佳的觀察方位和舒適的觀察姿勢。 同時(shí)C接口數(shù)碼相機(jī)可以通過一個(gè)0.7×的DSC接口安裝在人機(jī)工程學(xué)物鏡筒上。

    尼康生物顯微鏡配置了眼點(diǎn)提升器可將觀察點(diǎn)位置每次提高25mm(大100mm)，可旋轉(zhuǎn)的載物臺(tái)使圖像可存儲(chǔ)于各種角度及改善構(gòu)圖。旋轉(zhuǎn)與光軸方向敏感的樣本，如DIC，可以更好的改進(jìn)圖像對(duì)比度和細(xì)節(jié)，在后端口配置有一個(gè)0.8×-2.0×光學(xué)變倍機(jī)構(gòu)可使圖像縮放到所需要的倍數(shù)。與數(shù)碼變倍不同，光學(xué)變倍能讓相機(jī)的解析度和光學(xué)分辨率相匹配，輕松得到清晰流暢的圖像。尼康生物顯微鏡同時(shí)配置了兩個(gè)輸出端口可同時(shí)安裝多種成像設(shè)備。前端口使用的鏡頭少，適合用在共聚焦和定量測量上。尼康生物顯微鏡采用了尼康顯微鏡CFI60無限遠(yuǎn)光學(xué)物鏡齊焦距離為60mm，使得工作距離更長，NA值高，同時(shí)能產(chǎn)生清晰明亮的高對(duì)比度的圖像，同時(shí)配置了一個(gè)可容納各種中間模塊的靈活的升級(jí)空間。

    尼康生物顯微鏡堅(jiān)硬牢固的結(jié)構(gòu)更好的保證高精準(zhǔn)地對(duì)焦，更好的應(yīng)用了電腦輔助設(shè)計(jì)，顯著的增強(qiáng)了載物臺(tái)Z向運(yùn)動(dòng)及支持臂部分的穩(wěn)定性。極大地增強(qiáng)了其穩(wěn)定性，使得在高放大倍數(shù)觀察下不想要的圖像模糊和漂移減到少，提供佳的影像效果。尼康生物顯微鏡熒光成像中極佳的信噪比和對(duì)比度，采用了尼康獨(dú)一無二的高信噪比熒光系統(tǒng)由數(shù)字成像頭和通用的落射熒光照明組成。同時(shí)配置了雜光消除器可以消除濾光塊內(nèi)雜散光，信噪比提升了五倍，增加熒光顯微術(shù)圖像對(duì)比度，更進(jìn)一步地?cái)U(kuò)展探測水平的限度。尼康生物顯微鏡更好的使得在普通觀察或多重?zé)晒鈽颖境上駮r(shí)，操作者能更方便地在不改變?yōu)V光塊得情況下，進(jìn)一步加強(qiáng)特定波長激發(fā)光。通過在光路中調(diào)節(jié)激發(fā)平衡片的滑動(dòng)距離，更好的使得觀察各個(gè)通道的熒光強(qiáng)度得到平衡。